Química

Base de datos de proteínas

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Área de especialización - Bioquímica, modelado

En los últimos años, las bases de datos de proteínas se han convertido cada vez más en una herramienta indispensable en la investigación. Aquí, el conocimiento disponible sobre todas las propiedades de las proteínas (secuencia de aminoácidos, estructura, función, propiedades, relación, etc.) se recopila, clasifica y pone a disposición en cualquier momento. Las bases de datos de proteínas también proporcionan enlaces a publicaciones relevantes, bases de datos de secuencias de ácidos nucleicos y bases de datos que pueden usarse para calcular la conformación hipotética de una enzima.

Algunos ejemplos: el SWISS-PROT desarrollado en la Universidad de Ginebra (hoy una sección de UniProt), por ejemplo, contenía alrededor de 236.000 entradas de secuencia de más de 6.000 especies diferentes en octubre de 2006. SWISS-PROT está estrechamente vinculado al Brookhaven Protein Databank (PDB) (http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do), en el que actualmente se almacenan casi 40.000 estructuras de proteínas. Bases de datos como SCOP (clasificación estructural de proteínas), CATH (clasificación por clase, arquitectura, topología y homología) y FSSP (clasificación de pliegues basada en alineaciones estructura-estructura de proteínas) clasifican las proteínas de acuerdo con la similitud de secuencia y estructura, mientras que Prosite y Pfam (base de datos de familias de proteínas) Clasifican las proteínas en función de sus propiedades.

Unidades de aprendizaje en las que se trata el término

Diseño de fármacos basado en estructura60 min.

FarmaciaQuímica FarmaceúticaDiseño de fármacos

A diferencia del enfoque combinatorio del diseño de fármacos, que se basa en el cribado de una gran cantidad de compuestos sintetizados al azar, el diseño basado en la estructura, como su nombre indica, se basa en conocer la estructura del objetivo y / u otros ya conocidos. Ingredientes activos. En el primer caso, la proyección está en primer plano, en el segundo caso, el diseño. Por lo tanto, el enfoque basado en la estructura también se denomina diseño de fármaco racional o dirigido. Se basa en el supuesto fundamental de que el efecto de una sustancia resulta de su unión más o menos intensa a la molécula diana. También se supone que las dos moléculas en esta conformación, que se denomina activa o unida, se comportan de una manera geométrica y químicamente complementaria entre sí y, por lo tanto, provocan la bioactividad. En la mayoría de los casos, una sustancia solo logra un efecto biológico si encaja en el bolsillo de unión específico de un objetivo y se acopla (por ejemplo, en el centro activo de una enzima) y, por lo tanto, impide el acceso al ligando natural.


El Departamento de Química lleva la directrices aplicables a partir del 26 de junio de 2021 la gestión universitaria y cambia el concepto operativo con efecto inmediato de la siguiente manera (más información se puede encontrar en el concepto operativo detallado y en las páginas correspondientes de la universidad):

¡Actualmente no hay clases presenciales! Todas las conferencias se llevan a cabo en línea.

  • En todas las salas de acceso público (pasillos, escaleras, salas de conferencias, ascensores) siempre una máscara para ser usada.
  • La máscara solo se puede quitar en las cafeterías de los comedores de la Universidad de Basilea si se consumen alimentos y bebidas mientras se está sentado.

Trabajando en la universidad

  • Se recomienda que los miembros de la universidad trabajen desde casa siempre que sea posible.
  • Lo siguiente se aplica a todas las salas de trabajo Una máscara es obligatoria para dos o más personas.si no se puede mantener la distancia mínima de 1,5 metros. De lo contrario, ya no es obligatorio llevar máscara.
  • La investigación experimental no está restringida y debe continuarse en el marco de los conceptos de protección actuales.
  • Los aperitivos en las instalaciones de la Universidad de Basilea todavía están prohibidos. Los aperitivos fuera de las instalaciones de la Universidad de Basilea se pueden solicitar a través de Management & Corona Task Force.


Video: Qué son las BASES DE DATOS y cómo funcionan? (Agosto 2022).